事发后顾致远和小姨子唐小唯摒弃前嫌,开始追踪河兽的下落,顾致远抽丝剥茧,从河运开始查起,最后居然查到了坤爷头上,发现这头河兽是坤爷偷偷运到天津卫的,而且就藏在儿童医院。可当他们赶赴儿童医院时,院长武勋却说他本想用河兽做研究给孩子治病,谁知道实验失败导致河兽变异,现在已经失去控制不知所踪!特工伊森·亨特(汤姆·克鲁斯饰)和他的IMF小组将开启迄今为止最危险的一次任务:追踪一种会危及全人类性命的新型武器,并阻止其落入坏人之手。与此同时,伊森曾对抗过的黑暗势力也正在卷土重来,整个世界的命运岌岌可危。面对神秘而强大的敌人,他不得不面对选择使命还是至爱的终极抉择。